Pamukkale Üniversitesi kuruluş yasasında (03.07.1992 tarih ve
3837 sayılı) öngörülen teşkilat yapısında yer alan ve eğitim öğretim
faaliyetlerine 1995-1996 eğitim öğretim yılında 21 öğrenci ve 7 öğretim
elemanıyla başlayan Yüksekokulumuz ilk mezunlarını 1999 yılında vermiştir. 4 Mart 2022 tarihli ve 31768 sayılı Resmi Gazete’ de yayınlanan 5252 Sayılı Cumhurbaşkanı Kararı uyarınca Pamukkale Üniversitesi Fizik Tedavi ve Rehabilitasyon Yüksekokulu kapatılarak yerine Fizyoterapi ve Rehabilitasyon Fakültesi Fakültesi kurulmuştur. 2022-2023 Eğitim-Öğretim döneminde 25. dönem mezunlarını vermiştir.